六十年来，中心先后获得“全国地方病防治工作先进集体”、“全国结核病防治工作先进单位”、“抗震救灾医药卫生先进集体”、“全国丝虫病防治先进集体”、“全国卫生系统先进集体”、“全国卫生应急先进集体”、“全国医药卫生系统先进集体”等荣誉称号。