中心建有血吸虫病流行病学、包虫病流行病学及防治、放射防护、现场流行病学、结核病流行病学5个省医学重点学科；艾滋病确认实验室、病原微生物分子生物学实验室2个省医学重点实验室，口岸疫病疫情监测省重点实验室。

CX4全自动生化分析仪

VITEX32全自动微生物分析系统

液相色谱仪

消毒实验室

气相色谱－质谱联用仪

离子色谱仪

脊髓灰质炎实验室

HIV抗体确认实验室

尿碘实验室